Departamenti i Shkencave Detare është krijuar në Tetor 1998. Në degën “Navigacion”. Studentët e parë nisën formimim e tyre 4-vjeçar në vitin akademik 1998-1999. Profili “Navigacion” dhe “Peshkim Detar” u hap për herë të parë në vitin akademik 2002-2003, që konkretisht ndahet në “Navigacion” në vitin e tretë të studimeve. Kështu që studentët e Departamentit të Shkencave Nautike u diplomuan për herë të parë si navigatorë në vitin akademik 2001-2002 dhe navigatorë dhe peshkim detar në vitin akademik 2005 -2006.